はい、A 社とB 社が吸収合併し、同時に社名変更した場合、「.CO.JP」ドメインの新規取得が可能です。
社名変更をしない場合は、「.CO.JP」の新規取得を行うことはできません。
現在所有中の「.CO.JP」のドメイン名変更申請をおこなっていただくか、「.CO.JP」以外の新規ドメインをご取得いただくか、いずれかの方法をご検討ください。